近日，中南大学湘雅药学院曾文彬教授-董界副教授团队在国际权威期刊《Bioactive Materials》（中科院一区Top期刊，IF = 18.0）上发表了题为“Harnessing advanced computational approaches to design novel antimicrobial peptides against intracellular bacterial infections”的原创性研究论文，为抗胞内菌感染药物开发开辟全新路径。中南大学湘雅药学院为该论文的第一通讯单位。中南大学湘雅药学院2024级博士生房岩鹏为第一作者，曾文彬教授和董界副教授为共同通讯作者。

胞内菌可通过寄生于宿主细胞实现持续性感染，或利用“特洛伊木马”方式劫持巨噬细胞广泛传播实现多部位感染。目前，临床上对于胞内菌感染的治疗方案，主要依靠长期大剂量使用抗生素。然而，常规抗生素药物难以突破宿主细胞的生物膜屏障，不仅治疗效果大打折扣，还会带来严重的药物不良反应。

为了高效开发新型抗胞内菌感染药物，该团队开创性地将计算机辅助药物设计应用于抗胞内菌药物开发，提出整合人工智能预测、分子动力学模拟与实验验证的三位一体开发策略。针对胞内菌感染复杂生理环境，采用多级人工智能预测系统平衡候选药物的活性和毒性。基于跨尺度分子动力学模拟构建肽-膜相互作用综合评价体系，从原子层面解析候选分子的靶向性与作用机制。随后，制定系统的实验方案对于目标分子的生物活性进行全面验证。该研究成功从CPPsite 2.0数据库中筛选出候选药物Crot-1。实验结果表明，Crot-1可以高效清除寄生于巨噬细胞内的金黄色葡萄球菌，同时对宿主细胞保持良好的生物相容性。该研究不仅为抗胞内菌感染药物开发提供了新的途径，更构建了一套可扩展的计算驱动框架。其核心价值在于：宏观性质预测（AI）与微观机制解析（分子模拟）互补，突破传统试错模式；可适配不同靶点与疾病场景，为新型抗菌药物开发提供新的范式。

本研究得到了国家自然科学基金、国家重点研发计划、湖南省自然科学基金和中南大学创新驱动研究计划的支持。

原文链接：https://doi.org/10.1016/j.bioactmat.2025.04.016

（一审：董界，二审：刘苏友，三审：曹东升）