湘雅药学教育伴随医学教育始于1914年，培育出刘耕陶院士等杰出校友。药学作为独立的本科教育始于1985年，1996年建立药学系，1997年开始面向全国招收4年制药学专业本科学生。2002年由原湖南医科大学药学系、基础与临床药理研究所、湘雅附属三所临床学院的药学学科组建药学院，2016年11月更名为中南大学湘雅药学院。2018年开始招收临床药学专业本科学生。

目前形成了药物基因组学、心血管药理学、临床药学、器官纤维化创新药物研发、特殊递送系统制剂研发、模型引导的药物研发和个体化精准用药等多个特色学科方向，学科涵盖从药物研发到使用的各个环节，并相互支撑形成了强大的学科群优势。已建成药物基因组应用技术教育部工程研究中心、药物评价技术国家地方联合工程实验室、心血管研究湖南省重点实验室、遗传药理学湖南省重点实验室、慢病诊疗小分子药物发现与转化湖南省重点实验室、器官纤维化湖南省重点实验室、药物制剂优化与早期临床评价湖南省工程技术研究中心、湖南省贴剂类经皮递药系统工程技术研究中心等国家级和省级科研平台。是国家个体化诊疗技术国家工程研究中心的重要组成单位。是第一批国家级药学博士后科研流动站。

湘雅药学学科上榜US News、QS、ARWU、泰晤士世界四大学科排行榜，2022年在泰晤士排行榜学科专业排名为A+，软科排名为A。2023年软科学排名进入全球前50名，位居国内第4名，药理学与毒理学进入ESI前1‰。2019年药学入选国家一流本科专业建设点，2022年临床药学入选湖南省一流本科专业建设点。临床药学建设主要依托湘雅三所直属附属综合性医院，湘雅临床药学处于全国前列，在前两批15家国家临床药学重点专科建设单位遴选中，湘雅有两家附属医院入选（其中第一批1家，第二批1家）；近年来在复旦大学举办的临床药学排行榜评分体系中，湘雅医院临床药学成为科研评分的参考标杆。在教育部组织的历次学科评估中，湘雅药学学科始终处在优势方阵中。

以周宏灏院士为首席科学家的湘雅药学师资团队，现有教师100余人,高级职称教师以及具有博士学历的教师均占比80%以上。教师中有国家级和省级各类人才30余人，其中9人入选全球前2%顶尖科学家、5人入选全球前10万学术影响力排行榜、3人入选全球高被引学者。受聘于学科的兼职教授包括有国内知名中药资源学家、何梁何利基金科学与技术奖获得者、广州市“珠江科技新星”等一批中青年优秀人才。学院目前开设药学、临床药学两个本科专业，具有药学学术学位硕博士授予权、药学专业学位硕士授予权、生物与医药专业学位硕博士授予权，共有在校本科生480余人、硕博士研究生650余人。

2002年建院以来，先后获得973/863重大科技计划、国家重点研发计划、国家重大新药创制专项、国家自然科学基金（包括重大研究计划、重点项目等）、国际科技合作专项、教育部新世纪人才支持计划等国家级项目200余项。教师发表科学研究论文2000余篇，获得入校经费超3亿元。同时，学院积极对接“一带一路”，扩大国际视野，加强国际合作与交流，目前与加拿大女王大学、加拿大滑铁卢大学、澳大利亚莫纳什大学、乌兹别克斯坦塔什干制药研究院、香港浸会大学、澳门大学等知名大学和研究机构开展了教学科研合作。

学院始终瞄准生物医药的前沿领域，积极响应“健康中国”国家战略。以临床重大问题为导向，围绕器官纤维化、糖尿病肾病、肺动脉高压、肿瘤等领域开展创新药物研发，取得多项处于国际先进水平的成果，相关专利转让总合同金额超 2 亿元，其中 WZY-314 的单项转让合同金额近亿元。自主研发的多个药物筛选平台和数据库系统（如ADMETlab、DDInter、OptADMET、ChemFH、ChemoPy、 BioMedR等）已成为药物设计领域的基础工具，被知名药企和国内外同行（Pfizer、Merck、Novartis、哈佛大学、北京大学、上海药物所等）广泛采用，累计访问量达980万余次，为促进CADD的学科发展和药物研发的技术进步做出了贡献。自主研发的全球首个精准给药“基因脸谱”数字化系统平台入选湖南省 2021 年十大科技新闻。自主研发的临床药理建模与统计云平台（CPhaMAS）填补了国内空白。学院与众多医药企业密切合作，通过帮助企业科学合理制定药物研发策略和试验方案，为企业显著提升研发效率、节约大量研发成本，助力数十个创新药或仿制药的上市。依托产学研合作平台，孵化培育了多家药物研发公司，为服务区域经济、带动湖南医药产业的发展作出了重要贡献。